La maggior parte dei finanziamenti europei è gestita nei Paesi europei per il tramite dei governi centrali e delle regioni con un sistema di "gestione concorrente", essenzialmente mediante cinque grandi fondi, i Fondi strutturali e d'investimento cosiddetti fondi SIE attraverso i quali si mettono in atto le Programmazioni dell’Unione Europea che hanno una durata di sette anni:

Fondo europeo di sviluppo regionale (FESR): sviluppo regionale e urbano. Finanzia:

• innovazione e ricerca;
• agenda digitale;
• sostegno alle piccole e medie imprese (PMI);
• economia a basse emissioni di carbonio.

Fondo sociale europeo (FSE): inclusione sociale, formazione e buon governo. Finanzia:

• la promozione dell'occupazione e il sostegno alla mobilità dei lavoratori;
• la promozione dell'inclusione sociale e la lotta contro la povertà;
• l'investimento in istruzione, competenze e apprendimento permanente;
• il miglioramento della capacità istituzionale e l'efficienza dell'amministrazione pubblica.

Fondo di coesione (FC): convergenza economica delle regioni meno sviluppate. Finanzia in particolare iniziative legate al trasporto, all’ambiente e all’energia.

Fondo europeo agricolo per lo sviluppo rurale (FEASR). Finanzia le imprese agricole, la promozione dei prodotti agroalimentari. A livello regionale include il PSR Programma di Sviluppo Rurale che sostiene:

• lo sviluppo delle imprese rurali;
• gli insediamenti giovanili;
• la ristrutturazione degli immobili destinati alla produzione;
• l’acquisto di macchinari e strumentazioni.

La Misura 19 del PSR è destinata invece ai bandi dei GAL Gruppi di Azione Locale che attuano il programma Leader.

Fondo europeo per gli affari marittimi e la pesca (FEAMP). Finanzia le iniziative legate alla pesca sia di acqua dolce che salata.

I fondi sono gestiti attraverso le Autorità di Gestione che hanno una struttura nazionale, regionale o territoriale e sono anche le fonti che pubblicano i bandi ai quali presentare le domande di finanziamento.

Sia le imprese che le associazioni possono ottenere anche finanziamenti mediante prestiti e garanzie attraverso programmi gestiti a livello nazionale. Numerose sono le iniziative conto interesse che possono sommarsi ai bandi a fondo perduto.